北京市知识产权保护中心于2019年4月正式运行，是北京市知识产权局直属正处级公益一类事业单位。2021年4月，北京市知识产权保护中心与国家知识产权局专利局北京代办处重新组建为北京市知识产权保护中心(国家知识产权局专利局北京代办处)，主要承担专利预审、专利优先审查推荐、快速维权、专利导航、知识产权资助等方面工作，并受国家知识产权局委托，提供专利和商标受理、知识产权事务办理等服务。近年来，北京市知识产权保护中心先后获得全国青年文明号、国家知识产权局青年文明号、北京市青年文明号、北京市三八红旗集体、北京市司法行政系统先进集体等多项荣誉称号。